截至2020年12月底，2019年度江蘇省南京市市級預算執行和其他財政收支審計查出的14個方面44類156個問題已全部整改，糾正問題金額135.18億元，出臺制度62項；政府投資建設項目審計查出4個方面14類151個問題已整改完成150個,共落實核減金額33.41億元，出臺制度1項。12月29日，受市政府委托，市委常委、市政府常務副市長楊學鵬向市人大常委會報告了2019年度市級預算執行和其他財政收支及政府投資建設項目審計查出問題的整改情況。

針對重大政策落實跟蹤審計及“三大攻堅戰”專項審計查出問題，相關單位編制完成污泥處置專項規劃，推進全市水污染防治政策落實；2019年末，7754.20萬元入庫保險費差異額已全部查明具體原因并作賬務調整；全市出臺高新區管理體制改革方案，編制《投資南京政策索引》，出臺招商項目論證辦法，強化招商項目落地前期論證，相關單位出臺制度12項，理順8個高新區管理體制；3.63億元滯留科技專項資金已清理或撥付；新冠肺炎疫情防控醫護人員臨時性工作補貼4321.60萬元已發放到位；相關區將項目資本金產生的利息1.51億元沖減項目建設成本，減少支出預算。

針對市級財政管理審計查出問題，相關單位已將結余的29.80億元專項資金排入2020年預算盤活使用，滯留非稅收入專戶的86.79億元本級非稅收入已全部繳庫，6.13億元省下專項轉移支付資金已分配下達。針對企業審計查出問題，相關國有企業集團制定相關經營管理考核辦法、專項審計管理辦法規范自身管理。

針對部門預算執行審計查出問題，相關單位制定《南京市機關政務物業定額標準》規范物業管理，出臺《南京市慈善超市等級評定辦法》和《南京市慈善超市服務規范》加強相關領域管理，完成持有有價證券清理處置工作，涉及金額8817.24萬元。

針對市級專項資金績效審計查出問題，相關單位制定《南京市市級預算績效目標管理操作規程》和《南京市市級財政預算績效評價操作規程》加強資金績效管理，出臺《南京市級科技創新基金績效考核實施辦法》加強政府投資基金績效管理。

近期市政府辦公廳將印發實施方案，落實全國和省市人大常委會關于加強對審計查出突出問題整改情況監督的相關要求，進一步加強全市審計查出問題整改工作。審計部門將進一步加大跟蹤督查，完善對整改工作指導和服務機制，推動被審計單位公開審計整改情況。加強相關部門之間協作配合，建立審計整改質效評估機制，進一步提升整改工作成效。